Μάθημα : ΟΜΙΛΟΣ ΒΙΟΛΟΓΙΑΣ: "ΒΙΟΛΟΓΙΑ in vitro & in silico"

Καλησπέρα παιδιά,

για όσους έλειπαν ενημερώνω πως σήμερα κατά τη διάρκεια του ομίλου έγινε παρουσίαση της βάσης δεδομένων γονιδιωματικής ENSEMBL και αναλύθηκαν οι έννοιες των ορθόλογων και παράλογων γονιδίων/πρωτεϊνών. Μπορείτε να βρείτε πληροφορίες στις διαφάνειες 65-81 του ppt που υπάρχει στα έγγραφα. Για την επόμενη φορά έχετε να κάνετε αναζήτηση με τη λέξη κλειδί HSP90 στη βάση ΕNSEMBL ( https://www.ensembl.org/index.html ) προκειμένου να εξοικειωθείτε με το περιβάλλον και τα εργαλεία της. Στη συνέχεια μπορείτε να αναζητήσετε σε αυτή τη βάση ή στο NCBI (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/) τις ισομορφές της πρωτεϊνης HSP90 του ανθρώπου και αφού τις καταβάσετε σε fasta format να τις στοιχίσετε πολλαπλά με το CLUSTALW ( https://www.genome.jp/tools-bin/clustalw ). Παρόμοια αναζήτηση θα ήθελα να γίνει και για την πρωτεϊνη HSP90 του φυτού Arabidopsis thaliana. Τέλος μπορείτε να "κατεβάσετε" τις ορθόλογες πρωτεϊνες HSP90 από κάποια βάση (ENSEMBL ή NCBI) ώστε να διαπιστώσουμε την επόμενη φορά αν όντως είναι ορθόλογες.

ό,τι απορία έχετε ή για όποια διευκρίνηση θέλετε έιμαι στη διάθεσή σας.